Die BruderhausDiakonie ist eine Stiftung mit drei Vorständen als Geschäftsführer sowie dem Stiftungsrat als Aufsichtsratsgremien. Die BruderhausDiakonie ist in vier Geschäftsfelder, Altenhilfe, Behindertenhilfe, Jugendhilfe und Sozialpsychiatrie sowie in Regionen in Baden-Württemberg aufgeteilt.